Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TMOD4Q9NZQ9 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMOD4Q9NZQ9 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204 ms