Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CTXN3Q4LDR2 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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