Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms