Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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