Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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