Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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