Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms