Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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