Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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