Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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