Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CHAF1AQ13111 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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