Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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