Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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