Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXD4Q12950 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXD4Q12950 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXD4Q12950 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXD4Q12950 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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