Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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