Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TWF1Q12792 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms