Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN3Q9UPQ7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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