Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP1Q9UPQ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms