Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms