Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms