Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms