Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIS18AQ9NYP9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms