Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMILIN3Q9NT22 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms