Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00574Q9H8X3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms