Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms