Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms