Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM47Q9BQJ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM47Q9BQJ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms