Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP47Q96K76 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms