Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF333Q96JL9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms