Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms