Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM17Q96I25 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms