Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FAF2Q96CS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms