Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNKSR1Q969H4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNKSR1Q969H4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms