Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms