Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms