Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NME9Q86XW9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NME9Q86XW9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms