Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms