Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms