Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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