Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZKSCAN2Q63HK3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZKSCAN2Q63HK3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms