Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHYHD1Q5SRE7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms