Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms