Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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