Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS72Q15906 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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