Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN9AQ15858 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN9AQ15858 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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