Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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