Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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