Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM32Q13049 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM32Q13049 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms