Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms