Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms